标题
的多样性和多功能性Thermotoga maritima糖激酶组
文档类型
文章
出版日期
10 - 2012
出版来源
细菌学期刊
卷号
194年
问题数量
20.
第一页
5552年
最后一页
5563年
出版商
美国微生物学会
石头
0021 - 9193
文摘
糖磷酸化是不可或缺的关键步骤在各种各样的糖分解代谢的途径,而这些医院是主要的供应商在异养生物碳和能源。专业糖激酶是不可或缺的这些途径可以利用签名的酶对碳水化合物利用机械的重建微生物基因组和宏基因组数据。糖激酶结构发生在几个不同的家庭不同的未知部分重叠以及底物特异性,往往不能准确地分配同源技术。比利时vs俄罗斯比分subsystems-based代谢重建结合基因组上下文和随后的分析预测基因功能的实验测试功能基因的注释是一个功能强大的方法。这里我们应用这种集成方法所有糖激酶的功能映射构成一个广泛和多样化的糖激酶组嗜热细菌Thermotoga maritima。衬底偏好14激酶主要从FGGY PfkB家庭推断通过生物信息学分析和生化特征筛选面板的45个不同的碳水化合物。比利时vs俄罗斯比分大多数分析酶显示狭窄衬底偏好对应于他们的预测生理角色各自的异化的途径。观察到的一致性支持选择激酶作为genomics-based签名酶识别和重建糖的利用途径。整合基因组和实验方法的使用大大加速了鉴定的生化功能未知的蛋白质,提高重建质量的途径。
关键字
结构分类;ORNITHINE-DECARBOXYLASE;底物特异性;比较基因组学;大肠杆菌;激酶;序列;异构酶;酶;表达式
建议引用
Rodionova,伊丽娜。,陈杨,小青李,奥列格诉Kurnasov,亚伦a最好,安德烈·l·奥斯特曼and Dmitry A. Rodionov. "Diversity and Versatility of theThermotoga Maritima糖激酶组。”细菌学期刊194年,no. 20.00 (2012): 5552-5563.
评论
I.A.R.和C.Y.同样对本文亦有贡献。
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